鯉魚潭淨水場自鯉魚潭水庫取得原水，經分水井、適量加藥加氯、流經分水快混池、通過導水箱涵，分送至第一期之膠羽沉澱池及第二期之膠羽池及沉澱池、經快濾池處理後，送至清水池，再經由配水設施供水。沉澱池的廢水送至污泥濃縮池，快濾池反洗砂廢水送至廢水池，污泥濃縮池的污泥，送至污泥曬乾床處理後，委外清除再利用。廢水池的上澄液，則回收至分水井，再進行淨水處理。