萬華最早於1901年8月25日設立艋舺停車場，約在今中華路與愛國西路交叉口一帶，直至1918年遷移現址，才改建為融合東、西風貌的木造站房，1920年配合地方更名，始稱作「萬華站」，1921年至1965年曾經行駛萬華-公館的新店線通車，一度成為鐵路的端點車站。