寶山淨水場的水源取自頭前溪上游之上坪溪，在竹東鎮燥樹排設上坪溪攔河堰引水，經沉砂池降低濁度後，分別經竹東圳導水路引入寶山水庫，以及經寶二導水渠道引入寶二水庫蓄存並聯運用，再經由此二水庫水源聯通管，將原水送至寶山淨水場，提供新竹科學園區工業及民生用水。