澄清湖淨水場的淨水流程為自澄清湖取水後，經前臭氧接觸槽後進入膠凝、沉澱池、結晶軟化反應槽，使水質澄清，澄清後之水送至快濾池過濾，最後經生物活性碳濾床移除水中剩餘殘餘物質，存放至清水池並配送至市區。