新店溪過河隧道工程施工步驟，先於板橋端圍築長約140公尺之第一期圍堰，並於台北市端進行疏浚，以維流水斷面，而後進行明挖隧道施工，第一期圍堰拆除疏浚後，於台北端進行第二期圍堰155公尺，並進行明挖隧道施工，二期圍堰拆除，恢復河中原有斷面並進行河床保護。