高雄車站為地下四層車站，設有4處出入口，地下一樓為台鐵大廳層，地下二樓為台鐵月台層及捷運商場，地下三樓為捷運大廳層，設有公共藝術『港都懷舊．捷運新遊』，地下四樓為捷運月台層，設有一座島式月台及全高式月台門。